Nízkonákladové jízdenky začala nabízet na pravidelné lince Praha – Karlovy Vary. Nízkonákladové (t.z. Low Cost) jízdenky jsou určeny pro uživatele portálu Megabus.cz a jsou podmíněny rezervací přes internet.
Jízdenky lze zarezervovat v rezervačním systému portálu Megabus.cz a zaplatit lze pomocí Megabuskarty (ta umožňuje cestování bez jízdenky, jedná se o čipovou kartu, která slouží jako peněženka). Systém pracuje s několika cenovými pásmy rozloženými na kapacitu autobusu. Vzhledem k on-line zpracování umožňuje reakci na nabídky ostatních dopravců nebo na aktuální vytíženost linky. Díky on-line připojení autobusů může řidič i prodejce sledovat aktuální vytíženost spoje a může případným zájemcům nabídnout volná místa těsně do odjezdu.
Kalkulace ceny vychází opět ze zkušeností leteckých dopravců – nejlepší cenu dostanou ti, kdo svoji cestu plánují dostatečně dopředu. Nejnižší cena tak začíná již na 1,- Kč a získají ji zákazníci, kteří si cestu budou rezervovat alespoň 25 dnů před odjezdem.
Na portálu Megabus lze koupit i jízdenky společností Eurolines, ČSAD Karlovy Vary, Tourbus. Od 22. září také mezinárodní jízdenky dopravce PAVČAbus, který provozuje linku Praha – Dusseldorf.